在《火影本子网站》中，主角是一个热爱火影忍者的普通大学∵。一天，他意外发现了一款神秘的火影本子APP，并下载使用了起来。可没想到，这个APP竟然可以将他传送到火影世界中成为忍者！在那里他结识了鸣人、佐助等众多原著角色，并开始了自己的冒险之旅。面对强敌与险境，主角不断进化自身实力并展示出与众不同的智慧与战斗技巧。终极目标是保护和平、打败邪恶势力并最终成为火影！