《金田一少年事件簿R》讲述了高中生金田一一回归神奇推理之旅的故□□□。在著名侦探工藤新一夺命毒药组织事件后，他再次与青柳冴子、阿笠博士等人展开合作，解决迷题。然而，在新的社会案件调查中，他发现隐藏着更为深奥复杂的真相，并揭示出一个庞大的阴谋和凶手身份。同时，结识了志波海砂子这位神秘女性助手，他们携手追寻真相，展开惊心动魄的对决。